Ph.D. student, Department of Chemistry, University of Nizhny Novgorod
CONTACTS
- Email: vsnaumov@yandex.ru
- Phone: +7 930 804 89 85
RESEARCH INTERESTS
- molecular dynamics simulations
- force fields parametrization
- GROMOS force fields
- biological polymers: chitosan, insulin, RNA
- dissolution and aggregation of biological polymers
SOFTWARE: Gaussian, DFTB Plus, Gromacs, Plumed, Moltran, ChemCraft, VMD
PROGRAMMING LANGUAGES: Fortran, Python
PUBLICATIONS, INTERSHIPS, AWARDS, GRANTS
- Publications: 24 (4 papers)
- Internships: 2 (1 joint visit)
- Awards: 2
- Grants: 4
Publications 2020
- Structural, electronic, and thermodynamic properties of TiO2/organic clusters: performance of DFTB method with different parameter sets. Int J Quantum Chem. 2020;e26427. https://doi.org/10.1002/qua.26427 (DOWNLOAD PDF | DOWNLOAD DFTB tiorg-smooth parameters | DOWNLOAD DFTB get IR scripts) , , , et al.
Publications 2019
- Irina Glazova, Larisa Smirnova, Olga Zamyshlyayeva, Sergey Zaitsev, Alexander Avdoshin, Vladimir Naumov & Stanislav Ignatov Interpolymer interaction in insulin-chitosan complexes // Supramolecular Chemistry, 31(6), 412–423, doi: 10.1080/10610278.2019.1614180 (DOWNLOAD PDF)
- Игнатов Станислав Константинович, Наумов Владимир Сергеевич, Разуваев Алексей Григорьевич Глобальная оптимизация структуры металлических кластеров и свойства их низколежащих изомеров // XXXI симпозиум “Современная химическая физика” Сборник тезисов докладов.с.27 16–25.09.2019, г. Туапсе. Сборник аннотаций – 2019 г., стр. 25
Publications 2018
- Naumov, V. S. & Ignatov, S. K. Dissolution of chitosan nanocrystals in aqueous media of different acidity. Molecular dynamic study // Carbohydrate Polymers, 207, 619–627. doi:10.1016/j.carbpol.2018.12.019 (DOWNLOAD PDF)
- Наумов В.С, Игнатов С.К. Растворение полиаминогликанов в водных средах. Влияние кислотности среды и молекулярной массы полимера на кинетику растворения. Молекулярно-динамическое исследование // Современная химическая физика XXIX Симпозиум, 16–27 сентября 2018 года, г. Туапсе / Сборник тезисов – 2018 г., стр. 103
- Авдошин А.А., Наумов В.С., Игнатов С.К. Определение термодинамических и кинетических характеристик координации олигомеров хитозана с инсулином методами молекулярной динамики. Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул. // IX Всероссийская молодежная школа-конференция, Иваново, 19–23 ноября 2018 / Cборник научных статей — стр. 21–24
- С.В. Захаров, А.А. Авдошин, В.С. Наумов, С.К. Игнатов Диффузионные свойства аморфного полилактида. Молекулярно-динамическое исследование. Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул. // IX Всероссийская молодежная школа-конференция, Иваново, 19–23 ноября 2018 / Cборник научный статей — стр. 83–85
- S.K. Ignatov, V.S. Naumov, A.G. Razuvaev Platinum nanoparticles functionalized with chiral ligands. Molecular dynamic study with ReaxFF force field // CECAM workshop “Modeling metal-based nanoparticles: environment and dynamical effects” 3–5.12.2018 Grenoble, France.
- С.К. Игнатов, В.С. Наумов, А.Г. Разуваев Наночастицы платины, функционализированные хиральными лигандами. Молекулярно-динамическое исследование // ТЕЗИСЫ ДОКЛАДОВ Всероссийской конференции с международным участием «Химия твердого тела и функциональные материалы» и XII Всероссийского симпозиума с международным участием «Термодинамика и материаловедение» Санкт-Петербург 21–27 мая 2018 г. — стр. 64
Internships, Awards, Grants 2018
- Participant of RFBR Project 17–03-00912 “Сatalysis on chemically modified bimetallic nanoparticles of platinum-rhodium: the mechanism and ways for increasing of selectivity in the hydrogenation of bifunctional compounds”
- Participant of RFBR Project 18–33-00721 “The development of the hybrid materials for drug delivery systems based on gold nanoparticles functionalized by the biomarkers”
- Participant of RFBR Project 18–43-520012 “Development of methods and software for predictions of physico-chemical properties functional nanomaterials”
- Joint visit to CMS and HMI groups of Bremen Center for Computational Materials Science November 1 – December 15, 2018
- Winner of the scholarship of academician G.A. Razuvaev for the 2018–2019 academic year
Publications 2017
- Naumov, V.S. & Ignatov, S.K. Modification of 56ACARBO force field for molecular dynamic calculations of chitosan and its derivatives // J Mol Model (2017) 23: 244. https://doi.org/10.1007/s00894-017‑3421-x (DOWNLOAD PDF | DOWNLOAD Force Field)
- Наумов В.С., Игнатов С.К., Авдошин А.А. Растворение и ассоциация биологических полимеров в водных средах различной кислотности. Молекулярно-динамическое исследование // Современная химическая физика XXIX Симпозиум, 17–28 сентября 2017 года, г. Туапсе / Сборник тезисов – 2017 г., стр. 220
- V.S.Naumov, A.S. Loginova, S.K. Ignatov, T. Frauenheim Structure and electronic properties of polymeric composites based on titanium dioxide nanoparticles. DFT and DFTB study // 6-th School-Conference on Atomistic Simulation of Functional Materials (ASFM 2017 Winter), 7–8 December 2017, Moscow / Book of Abstracts. – 2017, p. 26
- А.А. Авдошин, В.С. Наумов, С.К. Игнатов ОПРЕДЕЛЕНИЕ ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИХ И КИНЕТИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК КООРДИНАЦИИ ОЛИГОМЕРОВ ХИТОЗАНА С ИНСУЛИНОМ МЕТОДАМИ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ // Всероссийская конференция по квантовой и математической химии (Уфа, 13–17 ноября 2017 г.): сб. тез. докл. / под ред. С.Л. Хурсана. ¬– Уфа: Изд-во УГНТУ, 2017. – стр. 27
Internships, Awards, Grants 2017
- Participant of RFBR Project 17–03-00912 “Сatalysis on chemically modified bimetallic nanoparticles of platinum-rhodium: the mechanism and ways for increasing of selectivity in the hydrogenation of bifunctional compounds”
Publications 2016
- В.С. Наумов, А.А. Авдошин, С.К. Игнатов Растворение и ассоциация хитозана и его комплексообразование с белковым субстратом. Молекулярно-динамическое исследование // Школа-конференция Атомистическое моделирование функциональных материалов ASFM2016, 24–25 мая, Москва / Тезисы докладов летней сессии (ASFM2016-1) - 2016 г., стр. 17
- А.В. Рожков, В.С. Наумов, С.К. Игнатов Кинетика диффузионных режимов реакций окиcлителей в кристаллах льда. Исследование методами молекулярной динамики и кинетического Монте-Карло // Школа-конференция Атомистическое моделирование функциональных материалов ASFM2016, 24–25 мая, Москва / Тезисы докладов летней сессии (ASFM2016-1) — 2016 г., стр. 21
- V.S. Naumov, A.A. Avdoshin, S.K. Ignatov Dissolution and association of chitosan and its complexation with protein substrate. Molecular dynamics study // International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design may 18–20, 2016 Kazan, Russia / Book of Abstracts and Scientific Program — 2016 г., стр. 47
- Наумов В.С., Игнатов С.К. Молекулярно-динамическое моделирование растворения кристалла хитозана: влияние кислотности среды и размеров полимера на кинетику растворения // Х Всероссийская молодежная научно-инновационная школа «Математика и математическое моделирование» 12–14 апреля 2016, Саров / Сборник материалов — 2016 г., стр. 121–122
- Авдошин А.А., Наумов В.С., Игнатов С.К. Молекулярно-динамическое исследование систем хитозана с инсулином // Х Всероссийская молодежная научно-инновационная школа «Математика и математическое моделирование» 12–14 апреля 2016, Саров / Сборник материалов — 2016 г., стр. 117–118
- Anastasiya S. Loginova, Vladimir S. Naumov, Evgeniya V. Salomatina, Larisa A. Smirnova, Stanislav K. Ignatov Structure and thermodynamic, electronic and spectral properties of photocatalysts based on the TiO2/HEMA nanocomposites. A DFT and DFTB study // Computational insight into photo-induced processes at interfaces October 10th – 14th 2016 Bremen Center for Computational Materials Science University of Bremen – 2016, page P23
Internships, Awards, Grants 2016
- Partisipant of RFBR Project 14–03-00585 “Elementary heterogeneous-catalytic reactions on chemically modified nanoparticles of platinum and VIII group metals: selective hydrogenation of bifunctional compounds”
- Visit to CMS group of Bremen Center for Computational Materials Science October 10 – November 10, 2016
- Диплом II степени Наумов Владимир Сергеевич // Х Всероссийская молодежная научно-инновационная школа «Математика и математическое моделирование» 12–14 апреля 2016, Саров
Other 2016
- Сертификат участника Наумов Владимир Сергеевич // Х Всероссийская молодежная научно-инновационная школа «Математика и математическое моделирование» 12–14 апреля 2016, Саров
- Certificate of participation Vladimir Naumov // International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design may 18–20, 2016 Kazan, Russia
- Сертификат участника Наумов Владимир Сергеевич // Школа-конференция Атомистическое моделирование функциональных материалов ASFM2016, 24–25 мая, Москва
- Confirmation Letter that Vladimir S. Naumov have participated in CECAM-Workshop “Computational insight into photo-inducted process at interfaces” and been guest at BCCMS for one month from October 10th until November 10th, 2016
Publications 2015
- Наумов В.С., Игнатов С.К. РАСТВОРЕНИЕ НАНОКРИСТАЛЛОВ ПОЛИАМИНОГЛИКАНОВ В ВОДНЫХ РАСТВОРАХ. МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ // «Квантово-xимические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул» VII Всероссийская молодежная школа-конференция. Сборник статей. – Иваново, 14–17 апреля 2015 г. – стр. 206–207.
- Наумов В.С., Игнатов С.К. РАСТВОРЕНИЕ И АССОЦИАЦИЯ ПОЛИАМИНОГЛЮКАНОВ В ВОДНЫХ РАСТВОРАХ РАЗЛИЧНОЙ КИСЛОТНОСТИ МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ // Международный научный форму «Бутлеровское наследие – 2015». – Казань, 17–22 мая 2015 г.
Internships, Awards, Grants 2015
- Partisipant of RFBR Project 14–03-00585 “Elementary heterogeneous-catalytic reactions on chemically modified nanoparticles of platinum and VIII group metals: selective hydrogenation of bifunctional compounds”
Publications 2014
- В.С. Наумов, С.К. Игнатов, А.Г. Разуваев, И.А. Глазова, А.Е. Мочалова Структура и растворимость аминозамещенных полигликанов в воде. Молекулярно-динамическое исследование // VIII Всероссийская конференция с международным участием молодых ученых по химии «Менделеев — 2014» Тезисы докладов. – Санкт-Петербург, 1–4 апреля 2014 г. – стр. 69–70.
- Наумов В.С., Игнатов С.К., Разуваев А.Г. МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПРОЦЕССА РАСТВОРЕНИЯ НАНОКРИСТАЛЛА ХИТОЗАНА В ВОДЕ // Математика и математическое моделирование Сборник материалов VIII Всероссийской молодежной научно-инновационной школы. – Саров, 8–11 апреля 2014 г. – стр. 90.
- В.С. Наумов, С.К. Игнатов, А.Г. Разуваев РАСТВОРЕНИЕ НАНОКРИСТАЛЛА ХИТОЗАНА В ВОДНЫХ СРЕДАХ РАЗЛИЧНОЙ КИСЛОТНОСТИ // Физические процессы в биологических системах. Всероссийская Интернет-конференция с международным участием. Материалы конференции. – 11 июня 2014 г. – стр. 45–47.
- В.С. Наумов, С.К. Игнатов, А.Г. Разуваев, А.Е. Мочалова, И.А. Глазова, Л.А. Смирнова СТРУКТУРА И РАСТВОРИМОСТЬ НАНОКРИСТАЛЛОВ ПОЛИАМИНОГЛИКАНОВ В ВОДЕ. МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ // Материалы XII международной конференции «Современные перспективы в исследовании хитина и хитозана». – Пермь, 23–28 июня 2014 г. – стр. 260–265.
- V.S. Naumov, S.K. Ignatov, A.G. Razuvaev, A.E. Mochalova, I.A. Glazova, L.A. Smirnova SOLUBILITY AND STRUCTURE OF CHITOSAN IN AQUEOUS MEDIA OF VARIOUS ACIDITY. MOLECULAR DYNAMIC STUDY // International Conference «Molecular Complexity in Modern Chemistry MCMC-2014» Book of Abstracts. – Moscow, 2014 September 13–19. – P. 220.
- Наумов В.С., Игнатов С.К. РАСТВОРЕНИЕ НАНОКРИСТАЛЛИЧЕСКОГО ХИТОЗАНА В ВОДНОЙ СРЕДЕ: МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ // «Атомистическое моделирование функциональных материалов ASFM2014» Школа-конференция Тезисы докладов. – Москва, 9–10 Декабря 2014 г. – стр. 29.
Internships, Awards, Grants 2014
- Partisipant of RFBR Project 14–03-00585 “Elementary heterogeneous-catalytic reactions on chemically modified nanoparticles of platinum and VIII group metals: selective hydrogenation of bifunctional compounds”